Die Schwammstotzen, die man überall an den Hängen im Altmühltal sieht, waren im Jura die Begrenzungen der Solnhofener Wannen, die diese voneinander trennten. Das Festland, bezeichnet als die Mitteldeutsche Insel da man die Ausdehnung nicht genau kennt, lag nach Rekonstruktionen weiter im Nord-Westen wohingegen die offene See, die Thetys, südlich im heutigen Alpenraum lag. Die Gegend um Solnhofen war ein Flachwassergebiet welches von Schwammriffen gesäumt war. Das Klima war subtropisch wovon die überlieferte Tier und Pflanzenwelt zeugen.
Durch dieses Monsumklima war eine hohe Verdunstungsrate gegeben, welche eine Übersalzung (Hypersalinität) und damit eine Schichtung des Wassers in den Wannen zur Folge hatte. Die Bodenzone war lebensfeindlich was sich durch fehlende Spuren von bodenlebenden Tieren zeigt, während in den überlagernden sauerstoffreicheren Wasserschichten in den Riffen und Wannen Leben möglich war.
Durch Stürme die in Abständen über den Lagunen fegten wurde das Sediment in die Wannen gedrückt (Wobei man immer noch nicht genau sagen kann woher dieses Sediment gekommen ist, Keupp z. B. geht davon aus das das Sediment zumindest teilweise vor Ort von Blaugrünalgen gebildet wurde.) und gleichzeitig die Wassermassen umgewälzt. Diese Umwälzung hatte zur Folge das Lebewesen in die Lagunen eingeschwemmt wurden bzw. fliegende Tiere in das Wasser stürzten und ertranken. Durch die Übersalzung und Sauerstoffarmut starben eingeschwemmte Tiere ebenso. Die Leichen sanken (z.T. nach einer gewissen Driftzeit) ab. Wenn diese durch sich erneut ablagerndes Sediment eingebettet wurden ist die heutige Erhaltung besonders gut. Länger driftende Leichen liegen in verschiedenen Erhaltungszuständen vor, manchmal mit Fraßspuren oder teilweise verwest und aufgelöst.
Die einzigen Tiere die diesem lebensfeindlichen Klima auf den Wannenböden zumindest eine kurze Zeit trotzen konnten waren die Pfeilschwanzkrebse (Mesolimulus walchi) und die Langarmkrebse (Mecochirus sp.), welche umgangssprachlich auch Schnorrgackel genannt werden. Von diesen sind manchmal Spuren zu finden die nicht selten zu dem Fossil des Tieres führen.